[解決済み】Rのデバッグ。"負の添え字と混在できるのは0のみ"
2022-01-24 21:36:34
質問
R Studioで手動で実行すると正常に動作するスクリプトがあるのですが、ラッパーを介して他のプログラムから実行すると動作しません。
デバッグ出力でこのような情報が得られます。
[912] Error in xj[i] : only 0's may be mixed with negative subscripts
[912] Calls: GetTopN -> cor -> is.data.frame -> [ -> [.data.frame
エラーが出る直前に画像を保存し、それをR Studioで読み込むと、同じエラーが出ます。
GetTopN(10)
. しかし、ステートメントを再実行すると
actionlist<- sqlQuery(channel,al_string)
をR Studioで実行した後
GetTopN(10)
はすべて正常に動作します。
クリティカルコールの直前にR Studio内で画像を保存し、GetTopN(10)を実行する前にラッパーを通して画像をロードしようともしましたが、同じエラーが発生しました。
確認したところ、関連する変数(crs,z,x,n)はすべて適切な値を持っているようです。何が原因なのか全く分からないので、是非ともご教授お願いします
実行されている内容は以下の通りです(順番に)。
#INIT:
library(RODBC)
library(stats)
channel<- odbcConnect("data")
crs<-mat.or.vec(3000,5) #will hold correlations
n1<-seq(-33,0)
#Get whole series
z <- sqlQuery(channel,"SELECT RPos,M1,M2,M3,M4 FROM `data`.`z` ")
al_string <- "SELECT RPos,OpenTime FROM z JOIN actionlist on(OpenTime = pTime)"
trim_string<- "DELETE FROM ActionList WHERE OpenTime NOT IN (SELECT OpenTime FROM ReducedList)"
GetTopN<-function(n)
{
for(i in 1:nrow(actionlist))
{
crs[i,1]<-actionlist$OpenTime[i]
for(j in 2:ncol(z))
{
crs[i,j]<-cor(z[actionlist$RPos[i]+n1,j],x[,j])
}
}
avc <- (cbind(crs[,1],rowSums(crs[,2:5])))
sorted <- crs[order(avc[,2], decreasing=T),1]
topx<- head(sorted,n)
bottomx <- tail(sorted,n)
DF<-as.data.frame(c(topx,bottomx),row.names=NULL)
colnames(DF)[1]<-'OpenTime'
sqlSave(channel,dat=DF,tablename='ReducedList',append=F,rownames=F,safer=F)
sqlQuery(channel,trim_string)
}
curpTime <- 1275266400
actionlist<- sqlQuery(channel,al_string)
x<- sqlQuery(channel,paste('SELECT pTime,M1,M2,M3,M4 FROM z WHERE pTime <= ',curpTime,' AND
pTime > ',curpTime,'-(300*34) ORDER BY pTime ASC'))
GetTopN(10)
ワークスペースも保存しておきましたので、参考になればと思います(4.7mb)。 ワークスペース MYSQL データベースに接続すれば、次の場所で開いているはずです。 {コード
解決するには?
問題点
{コード
{コード
の値は21です。
74.73.17.163:3306
actionlist$RPos[1000]
n1
このことから、問題があるのは
traceback()
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