警告が出る。predict.lm で " 'newdata' は1行でしたが、見つかった変数は32行でした" という警告が表示されました。

質問

Rでpredictとlm関数を使用していて、同じデータに対してデータフレームとベクトルで異なる結果が出るという不具合がありました。

DataFrameのコードです。

data(mtcars)
fitCar<-lm(mtcars$mpg~mtcars$wt)
predict(fitCar,
        data.frame(x=mean(mtcars$wt)),
        interval="confidence")

出力します。

     fit       lwr      upr
1  23.282611 21.988668 24.57655
2  21.919770 20.752751 23.08679
3  24.885952 23.383008 26.38890
4  20.102650 19.003004 21.20230
5  18.900144 17.771469 20.02882
6  18.793255 17.659216 19.92729
7  18.205363 17.034274 19.37645
8  20.236262 19.136179 21.33635
9  20.450041 19.347720 21.55236
10 18.900144 17.771469 20.02882
11 18.900144 17.771469 20.02882
12 15.533127 14.064349 17.00190
13 17.350247 16.104455 18.59604
14 17.083024 15.809403 18.35664
15  9.226650  6.658271 11.79503
16  8.296712  5.547468 11.04596
17  8.718926  6.052112 11.38574
18 25.527289 23.927797 27.12678
19 28.653805 26.519252 30.78836
20 27.478021 25.554415 29.40163
21 24.111004 22.715653 25.50635
22 18.472586 17.319886 19.62529
23 18.926866 17.799465 20.05427
24 16.762355 15.452833 18.07188
25 16.735633 15.423002 18.04826
26 26.943574 25.112491 28.77466
27 25.847957 24.198041 27.49787
28 29.198941 26.963760 31.43412
29 20.343151 19.242185 21.44412
30 22.480940 21.268498 23.69338
31 18.205363 17.034274 19.37645
32 22.427495 21.219818 23.63517

警告メッセージです。

newdata'は1行でしたが、見つかった変数は32行ありました。

両方のデータをベクトルに分離したところ、違う答えが返ってきました。

ベクトルのコード

predict(fit,data.frame(x=mean(x)), interval="confidence")

出力します。

    fit   lwr   upr
1 20.09 18.99 21.19

この差の理由は何でしょうか？

どのように解決するのですか？

この問題は、各自の data と newdata であり、vectorやdataframeを使用しても問題ありません。

でモデルを当てはめると lm 関数でフィットし、その後 predict を使って予測する。 predict で同じ名前を見つけようとします。 newdata . 最初のケースの名前 x と矛盾します。 mtcars$wt と衝突しているため、警告が表示されます。

ここで、私が言っていることの説明図をご覧ください。

これは、あなたがやってもエラーにならなかったものです。

a <- mtcars$mpg
x <- mtcars$wt

#here you use x as a name
fitCar <- lm(a ~ x) 
#here you use x again as a name in newdata.
predict(fitCar, data.frame(x = mean(x)), interval = "confidence") 

       fit      lwr      upr
1 20.09062 18.99098 21.19027

この場合、xという名前を使ってモデルを適合させ、また、xという名前を使って予測するために newdata . この方法では、警告は出ませんし、期待通りです。

モデルを当てはめるときに、名前を他のものに変えるとどうなるか見てみましょう。

a <- mtcars$mpg
#name it b this time
b <- mtcars$wt 

fitCar <- lm(a ~ b) 
#here I am using name x as previously
predict(fitCar, data.frame(x = mean(x)), interval = "confidence") 

         fit       lwr      upr
1  23.282611 21.988668 24.57655
2  21.919770 20.752751 23.08679
3  24.885952 23.383008 26.38890
4  20.102650 19.003004 21.20230
5  18.900144 17.771469 20.02882
Warning message:
'newdata' had 1 row but variables found have 32 rows 

今やったことは、名前を変更しただけです。 x に変更したことだけです。 b という名前を使って予測し x の中にある newdata . ご覧の通り、ご質問と同じエラーが発生しました。

これではっきりしたでしょうか？