[解決済み] ggplot 2.0.0でのポイントサイズ
質問
ggplot 2.0.0にアップデートしてから、プロットの再作成に問題があります。 以下の例では、plot1 と plot2 の間のポイントサイズにはそれなりの差があり、plot3 のポイントサイズは少なくとも少し小さくなっていますが、plot3 と plot4 の間にはポイントサイズに差がありません。
df <- data.frame(x=1:10, y=runif(10))
pl <- ggplot(df) +
geom_point(aes(x,y), size=1)
ggsave("plot1.png", plot=pl, width=14, height=7, units="cm", dpi=1200 )
pl <- ggplot(df) +
geom_point(aes(x,y), size=0.1)
ggsave("plot2.png", plot=pl, width=14, height=7, units="cm", dpi=1200 )
pl <- ggplot(df) +
geom_point(aes(x,y), size=0.01)
ggsave("plot3.png", plot=pl, width=14, height=7, units="cm", dpi=1200 )
pl <- ggplot(df) +
geom_point(aes(x,y), size=0.001)
ggsave("plot4.png", plot=pl, width=14, height=7, units="cm", dpi=1200 )
以前のバージョンのggplot2ではポイントサイズを0.25にしていたのですが、今よりずっと小さく見えてしまったので、新しいバージョンのggplot2を使ってさらに小さくしようとしたわけです。新バージョンのコードの変更を見逃しているのでしょうか?ドキュメントでは何も見つかりませんでしたが...。
解決方法は?
OK、解決策が見つかりました。henrik と @silkita が指摘したように、最新の ggplot2 リリースでは、デフォルトの形状が 16 から 19 に変更されています。そして、ドキュメントで見ることができるように、(例えば
ここで
) 形状 '19' は '16' よりもわずかに大きいです。しかし、バージョン 2.0.0 で "points" が大きくなった理由は、これではありません。のggplot2ソースを見ると、以下のようになります。
geom-point.R
を見ると、最新のリリースのものがあることがわかります。
default_aes = aes(
shape = 19, colour = "black", size = 1.5, fill = NA,
alpha = NA, stroke = 0.5
)
以前のリリースではそうであったのに。
default_aes <- function(.) aes(shape=16, colour="black", size=2, fill = NA, alpha = NA)
そして、先ほどと同じように小さな点を持つようにするために
stroke
をゼロにします。まとめると、最小の点を得るにはこう書けばよい。
geom_point(size = 0.1) # ggplot2 before 2.0.0
geom_point(size = 0.1, stroke = 0, shape = 16) # ggplot2 2.0.0
ちなみに、最小の点を扱う場合、異なる形状を使用しても違いはありません(ピクセルはピクセルのままです)。
アップデイト : Hadley Wickham氏のTwitterで指摘されたように、この変更については リリースノート
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