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[解決済み】ValueError: 配列の要素をシーケンスで設定する

2022-04-07 20:51:15

質問

このPythonのコードは。

import numpy as p

def firstfunction():
    UnFilteredDuringExSummaryOfMeansArray = []
    MeanOutputHeader=['TestID','ConditionName','FilterType','RRMean','HRMean',
                      'dZdtMaxVoltageMean','BZMean','ZXMean','LVETMean','Z0Mean',
                      'StrokeVolumeMean','CardiacOutputMean','VelocityIndexMean']
    dataMatrix = BeatByBeatMatrixOfMatrices[column]
    roughTrimmedMatrix = p.array(dataMatrix[1:,1:17])


    trimmedMatrix = p.array(roughTrimmedMatrix,dtype=p.float64)  #ERROR THROWN HERE


    myMeans = p.mean(trimmedMatrix,axis=0,dtype=p.float64)
    conditionMeansArray = [TestID,testCondition,'UnfilteredBefore',myMeans[3], myMeans[4], 
                           myMeans[6], myMeans[9], myMeans[10], myMeans[11], myMeans[12],
                           myMeans[13], myMeans[14], myMeans[15]]
    UnFilteredDuringExSummaryOfMeansArray.append(conditionMeansArray)
    secondfunction(UnFilteredDuringExSummaryOfMeansArray)
    return

def secondfunction(UnFilteredDuringExSummaryOfMeansArray):
    RRDuringArray = p.array(UnFilteredDuringExSummaryOfMeansArray,dtype=p.float64)[1:,3]
    return

firstfunction()

このエラーメッセージを投げます。

File "mypath\mypythonscript.py", line 3484, in secondfunction
RRDuringArray = p.array(UnFilteredDuringExSummaryOfMeansArray,dtype=p.float64)[1:,3]
ValueError: setting an array element with a sequence.

どなたか、上記の壊れたコードの問題を解決して、エラーメッセージを投げなくする方法を教えていただけませんか?


EDITです。 行列の内容を取得するためにprintコマンドを実行したところ、このように出力されました。

UnFilteredDuringExSummaryOfMeansArrayは。

[['TestID', 'ConditionName', 'FilterType', 'RRMean', 'HRMean', 'dZdtMaxVoltageMean', 'BZMean', 'ZXMean', 'LVETMean', 'Z0Mean', 'StrokeVolumeMean', 'CardiacOutputMean', 'VelocityIndexMean'],
[u'HF101710', 'PreEx10SecondsBEFORE', 'UnfilteredBefore', 0.90670000000000006, 66.257731979420001, 1.8305673000000002, 0.11750000000000001, 0.15120546389880002, 0.26870546389879996, 27.628261216480002, 86.944190346160013, 5.767261352345999, 0.066259118585869997],
[u'HF101710', '25W10SecondsBEFORE', 'UnfilteredBefore', 0.68478571428571422, 87.727887206978565, 2.2965444125714285, 0.099642857142857144, 0.14952476549885715, 0.24916762264164286, 27.010483303721429, 103.5237336525, 9.0682762747642869, 0.085022572648242867],
[u'HF101710', '50W10SecondsBEFORE', 'UnfilteredBefore', 0.54188235294117659, 110.74841107829413, 2.6719262705882354, 0.077705882352917643, 0.15051306356552943, 0.2282189459185294, 26.768787504858825, 111.22827075238826, 12.329456404418824, 0.099814258468417641],
[u'HF101710', '75W10SecondsBEFORE', 'UnfilteredBefore', 0.4561904761904762, 131.52996981880955, 3.1818159523809522, 0.074714285714290493, 0.13459344175047619, 0.20930772746485715, 26.391156337028569, 123.27387909873812, 16.214243779323812, 0.1205685359981619]]

5行×13列の行列のように見えますが、異なるデータをスクリプトで実行すると、行の数は変化します。 これと同じデータを追加しているところです。

EDIT 2 : しかし、スクリプトはエラーを投げています。 ですから、あなたのアイデアは、ここで起こっている問題を説明しているとは思えません。 でも、ありがとうございます。 他のアイデアはありますか?


EDIT 3:

参考までに、この問題行のコードを置き換えると。

    RRDuringArray = p.array(UnFilteredDuringExSummaryOfMeansArray,dtype=p.float64)[1:,3]

を、代わりにこうします。

    RRDuringArray = p.array(UnFilteredDuringExSummaryOfMeansArray)[1:,3]

すると、スクリプトのその部分はエラーを出さずにうまく動作するのですが、さらにその下にあるこのコード行が表示されます。

p.ylim(.5*RRDuringArray.min(),1.5*RRDuringArray.max())

このエラーを投げます。

File "mypath\mypythonscript.py", line 3631, in CreateSummaryGraphics
  p.ylim(.5*RRDuringArray.min(),1.5*RRDuringArray.max())
TypeError: cannot perform reduce with flexible type

matplotlib で ylim を使えるようにするためにはデータ型を指定する必要がありますが、データ型を指定してもこの投稿のきっかけとなるエラーメッセージが投げられます。

どうすればいいですか?

あなたが示したコードからわかることは、多次元配列のような形をしていないリストから配列を作成しようとしていることです。 例えば

numpy.array([[1,2], [2, 3, 4]])          # wrong!

または

numpy.array([[1,2], [2, [3, 4]]])        # wrong!

これは、入力リストの形状が多次元配列に変換できる(一般化された)"box" ではないからです。 したがって、おそらく UnFilteredDuringExSummaryOfMeansArray には、長さの異なる配列が含まれています。

このエラーメッセージが表示されるもう一つの可能性は、文字列を float :

numpy.array([1.2, "abc"], dtype=float)   # wrong!

あなたの編集によると、それはあなたが試みていることです。 もし、本当に文字列と浮動小数点数の両方を含むNumPyの配列を持ちたいのであれば、dtypeの object これは、配列に任意の Python オブジェクトを格納することを可能にします。

numpy.array([1.2, "abc"], dtype=object)

あなたのコードが何を達成しようとしているのか分からないと、これがあなたが望むものなのかどうか、私には分かりません。