[解決済み】SciPyとNumPyの関係
質問
SciPyはNumPyの関数のほとんど(すべてではない[1])を独自の名前空間で提供しているようです。言い換えれば、もし
numpy.foo
があれば、ほぼ間違いなく
scipy.foo
. ほとんどの場合、この2つは全く同じに見え、時には同じ関数オブジェクトを指していることさえあります。
時には、異なることもあります。最近出てきた例を挙げますと
-
numpy.log10
は ユーファンク は、負の引数に対してNaNを返します。 -
scipy.log10
は負の引数に対して複素数を返し、ufunc ではないようです。
についても同じことが言えます。
log
,
log2
と
logn
についてではなく
log1p
[2].
一方
numpy.exp
と
scipy.exp
は、同じ ufunc に対して異なる名前であるように見えます。これは
scipy.log1p
と
numpy.log1p
.
別の例として
numpy.linalg.solve
対
scipy.linalg.solve
. 両者は似ていますが、後者は前者よりいくつかの追加機能を備えています。
なぜ重複しているように見えるのか?もし、これが
numpy
を
scipy
という名前空間がありますが、なぜ微妙に動作が違ったり、関数がなかったりするのでしょうか?この混乱を解消するための包括的なロジックはあるのでしょうか?
[1]
numpy.min
,
numpy.max
,
numpy.abs
に対応するものがありません。
scipy
名前空間を使用します。
[2] NumPy 1.5.1 と SciPy 0.9.0rc2 を使ってテストしています。
どのように解決するのですか?
前回確認したところ、scipyの
__init__
メソッドが実行されます。
from numpy import *
scipyモジュールがインポートされたときに、numpyの名前空間全体がscipyに含まれるようにするためです。
は
log10
の動作は興味深いものです。
どちらも
のバージョンはnumpyから来ています。一方は
ufunc
もうひとつは
numpy.lib
関数を使用します。なぜscipyはライブラリ関数よりも
ufunc
というのも、私の頭ではわからないのです。
編集部:実は、答えられるのは
log10
の質問をします。scipyの中を見ると
__init__
メソッドを見ると、こんな感じです。
# Import numpy symbols to scipy name space
import numpy as _num
from numpy import oldnumeric
from numpy import *
from numpy.random import rand, randn
from numpy.fft import fft, ifft
from numpy.lib.scimath import *
は
log10
は、scipy で取得した関数に由来します。
numpy.lib.scimath
. そのコードを見ると、こう書いてある。
"""
Wrapper functions to more user-friendly calling of certain math functions
whose output data-type is different than the input data-type in certain
domains of the input.
For example, for functions like log() with branch cuts, the versions in this
module provide the mathematically valid answers in the complex plane:
>>> import math
>>> from numpy.lib import scimath
>>> scimath.log(-math.exp(1)) == (1+1j*math.pi)
True
Similarly, sqrt(), other base logarithms, power() and trig functions are
correctly handled. See their respective docstrings for specific examples.
"""
の numpy の基本的な ufuncs をオーバーレイするモジュールのようです。
sqrt
,
log
,
log2
,
logn
,
log10
,
power
,
arccos
,
arcsin
および
arctanh
. これであなたが見ている動作が説明できます。なぜこのような動作をするのかという根本的な設計理由は、おそらくどこかのメーリングリストの投稿に埋もれているはずです。
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