[解決済み】Numpyのstd計算。TypeError: cannot perform reduce with flexible type.
2022-01-25 18:57:28
質問
7行目から始まる数値の行を読み、データがなくなるまで数値をリストにまとめ、このリストに対して標準偏差と%rmsを計算しようとしています。簡単そうに見えますが、エラーが出続けています。
Traceback (most recent call last):
File "rmscalc.py", line 21, in <module>
std = np.std(values)
File "/System/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/Extras/lib/python/numpy/core/fromnumeric.py", line 2817, in std
keepdims=keepdims)
File "/System/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/Extras/lib/python/numpy/core/_methods.py", line 116, in _std
keepdims=keepdims)
File "/System/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/Extras/lib/python/numpy/core/_methods.py", line 86, in _var
arrmean = um.add.reduce(arr, axis=axis, dtype=dtype, keepdims=True)
TypeError: cannot perform reduce with flexible type
以下は私のコードです。
import numpy as np
import glob
import os
values = []
line_number = 6
road = '/Users/allisondavis/Documents/HCl'
for pbpfile in glob.glob(os.path.join(road, 'pbpfile*')):
lines = open(pbpfile, 'r').readlines()
while line_number < 400 :
if lines[line_number] == '\n':
break
else:
variables = lines[line_number].split()
values.append(variables)
line_number = line_number + 3
print values
a = np.asarray(values).astype(np.float32)
std = np.std(a)
rms = std * 100
print rms
編集:rmsを生成しますが(これは間違っています - 理由はまだわかりません)、次のエラーメッセージは紛らわしいです。カウントを高くする必要があります(どんなに大きなファイルでも全部取得できるように400を選びました)。
Traceback (most recent call last):
File "rmscalc.py", line 13, in <module>
if lines[line_number] == '\n':
IndexError: list index out of range
解決方法は?
values
は文字列配列であり
a
. 変換する
a
を使用して数値型に変換します。
astype
. 例えば
a = np.asarray(values).astype(np.float32)
std = np.std(a)
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