Matplotlib のオーバーラップするアノテーション / テキスト

質問

グラフで注釈テキストが重ならないようにしようとしています。の回答で提案された方法は Matplotlibのオーバーラップする注釈 は非常に有望に見えますが、しかし、棒グラフのためのものです。私は"axis"メソッドを私がやりたいことに変換するのに苦労しており、テキストがどのように並んでいるのか理解できません。

import sys
import matplotlib.pyplot as plt


# start new plot
plt.clf()
plt.xlabel("Proportional Euclidean Distance")
plt.ylabel("Percentage Timewindows Attended")
plt.title("Test plot")

together = [(0, 1.0, 0.4), (25, 1.0127692669427917, 0.41), (50, 1.016404709797609, 0.41), (75, 1.1043426359673716, 0.42), (100, 1.1610446924342996, 0.44), (125, 1.1685687930691457, 0.43), (150, 1.3486407784550272, 0.45), (250, 1.4013999168008104, 0.45)]
together.sort()

for x,y,z in together:
    plt.annotate(str(x), xy=(y, z), size=8)

eucs = [y for (x,y,z) in together]
covers = [z for (x,y,z) in together]

p1 = plt.plot(eucs,covers,color="black", alpha=0.5)

plt.savefig("test.png")

画像は(これがうまくいけば) ここで (このコード) にあります。

そして ここで (もっと複雑)です。

どのように解決するのですか？

このようなことを実装するために書いた小さなライブラリをここに掲載したいと思います。 https://github.com/Phlya/adjustText 処理の例はこちらで見ることができます。

以下は画像例です。

import matplotlib.pyplot as plt
from adjustText import adjust_text
import numpy as np
together = [(0, 1.0, 0.4), (25, 1.0127692669427917, 0.41), (50, 1.016404709797609, 0.41), (75, 1.1043426359673716, 0.42), (100, 1.1610446924342996, 0.44), (125, 1.1685687930691457, 0.43), (150, 1.3486407784550272, 0.45), (250, 1.4013999168008104, 0.45)]
together.sort()

text = [x for (x,y,z) in together]
eucs = [y for (x,y,z) in together]
covers = [z for (x,y,z) in together]

p1 = plt.plot(eucs,covers,color="black", alpha=0.5)
texts = []
for x, y, s in zip(eucs, covers, text):
    texts.append(plt.text(x, y, s))

plt.xlabel("Proportional Euclidean Distance")
plt.ylabel("Percentage Timewindows Attended")
plt.title("Test plot")
adjust_text(texts, only_move={'points':'y', 'texts':'y'}, arrowprops=dict(arrowstyle="->", color='r', lw=0.5))
plt.show()

もし、完璧な図を作りたいのであれば、少しいじくりまわすことができます。まず、テキストが線に反発するようにしましょう。そのためには、scipy.interpolate.interp1dを使って、線に沿ってたくさんの仮想点を作成するだけです。

ラベルをX軸に沿って移動させないようにしたいのですが、なぜかというと、説明のために移動させないようにするためです。そのために、パラメータ only_move={'points':'y', 'text':'y'} . もしラベルがテキストと重なる場合のみx軸に沿って移動させたい場合は move_only={'points':'y', 'text':'xy'} . また、この関数は、初めにテキストの元の位置に対する最適な配置を選択するので、y軸方向にもそれが起こるようにしたい場合は、そのように autoalign='y' . また、人為的に線を避けたためにテキストが遠くに飛んでいってしまうのを避けるため、点からの反発力を弱めています。すべて一緒です。

from scipy import interpolate
p1 = plt.plot(eucs,covers,color="black", alpha=0.5)
texts = []
for x, y, s in zip(eucs, covers, text):
    texts.append(plt.text(x, y, s))

f = interpolate.interp1d(eucs, covers)
x = np.arange(min(eucs), max(eucs), 0.0005)
y = f(x)    
    
plt.xlabel("Proportional Euclidean Distance")
plt.ylabel("Percentage Timewindows Attended")
plt.title("Test plot")
adjust_text(texts, x=x, y=y, autoalign='y',
            only_move={'points':'y', 'text':'y'}, force_points=0.15,
            arrowprops=dict(arrowstyle="->", color='r', lw=0.5))
plt.show()